其次，两岸和平协议可能算是内战双方的协议，但此一内战的武力冲突部分已停止了多年，60年间内战两边隔海对峙形成一种僵持和平与交流和平阶段。尤其近几年双方在和平发展的大政方针引导下，制度化的交流合作增加，双方力图减少猜疑与敌视，致力建立和平发展的氛围与实际。很难想像当前的态势仍然是一种单纯内战的延续。
第三，由于双方的大小、强弱、体制相异，台湾作为一个比较小，军事力量的对比相对不利，在外交或国际上受到限缩，经济总量跟大陆相比将来的差距可能是越来越大的实体，其自我防卫的心态也十分强烈。深怕情势的变化对自身不利，也恐怕任何和平协议的协商或协议的达成产生损害我们自身尊严或拘束我们自主性的后果，所以我们自己凝聚共识比较困难，执政当局即使有心也是战战兢兢，唯恐损害到国家的主权，唯恐被批判为违背台湾人民的利益，唯恐被中共拖进其轨道当中而无以自拔。所以有时候虽然会提和平协议的相关问题，但不是附加很多复杂的条件，就是认为协商的时机还没有成熟，从而将此一虽然重要，但目前被视为并不迫切的诉求加以搁置，我们必须理解这点。
第四，在台湾内部有部分人士企图塑造一种特殊的历史经验、文化价值与族群认同，而此一认同又因未获得多数支持，国际承认并认为受到大陆打压，产生心理上的被剥削感，演变成寻求自我认同，寻求国际承认，寻求对抗压迫的他者的努力。另一方面，大陆亦有强悍的民族主义或民粹主义势力，对两岸关系的本质与发展速度，有相当尖锐性的看法。
两种思维，两种力量相激相荡，亦可能使两岸关系越出和平发展的正轨，所以两岸的和平协议非仅要追求大陆与台湾之间两岸执政当局的协议，也要追求两岸内部各种政治社会势力之间的协议，此一和平才易达成，也才易持久；更重要的是要寻求两岸各阶层人民间的和平、信任与友爱；最后，要凝聚出重迭性的认同。
第五，缔结和平协议的目的是结束两岸敌对状态，巩固和平发展的路线。由于大陆方面坚持一个中国原则，而和平协议就是为了解决所谓台湾问题，因而在台湾内部就出现相当大的疑虑和反对声音。他们认为中共当局试图用其一中原则来否认协议的国际条约性质，藉机要国际社会承认两岸属于内战状态，矮化“中华民国”台湾的主权地位。台海关系将被视为中国的内政问题，从而排斥任何外国势力的介入，以符合联合国宪章“不干涉内政”原则。也因此一旦两岸再度发生冲突，其他国家调停介入均增加了难度，对台湾不利。这些人士因而极力排斥在条件不具备下进行和平谈判。 |
