在外在的形势压力下，台湾官方可能会做出相应的调整。但郑端耀认为，要想让官方真正地做出改变，就目前而言，应当先解决几个问题。首先，要改变认识，尤其在两岸定位问题上。两岸究竟要定位为亲如一家、同一个屋檐下的亲兄弟？还是已经分家的兄弟？如果，定位为一家子的兄弟，那对于中华民族祖先留下的共同海权，就应该共同享有、共同利用、共同开发和维护。并且，当外界对两岸共同拥有的海权形成挑战的时候，双方应该联手合作。
反之，如果两岸仍然有隔阂和顾忌，且分开处理有关中华民族祖先留下的共同财产，甚至认为在国际上不方便共同合作。这种情况，就会让双方关系变得更加变扭。其次，由于台湾是一个民主地区，应该让台湾的民众认知到，两岸关系和对外关系二者哪个更重要。如果，两岸关系比较重要，就应该把共同的利益和权利高于对外关系。
郑端耀说，在处理好以上的定位和认识问题后，台湾还要有前瞻的心态，勇敢地区面对海洋问题。在不影响和美日关系的维持情况下，和大陆在这个问题上进行初步的沟通互动，从而共同合作发展。
郑端耀指出，目前两岸在海洋战略合作问题上还处于起步阶段。要想真正达成两岸海洋战略合作目标，建立一个基本的认知和共识显得非常重要。两岸的学者可以公开倡议，呼吁大家共同认识、重视这个问题。同时，建立公开论坛，逐步汇聚各方面的意见，尝试形成一些共识。两岸可以逐渐地从低阶迈向高阶，从一些海洋技术上方面的合作到高阶敏感的海权、战略合作等。
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